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商品編號:27160

AT4301-01 ATPure Plus beads(DNA片段分選純化磁珠)

剩余數量:00門店價:¥0
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產品分類

 磁珠參數:

此試劑盒所用磁珠為杭州開泰生物技術有限公司為NGS核酸片段篩選專門開發的磁珠(貨號:HT3001

試劑盒儲存條件及穩定性

       試劑盒內組分室溫保存即可,在適合的儲存條件下該試劑盒未開封使用有效期為2年。

產品簡介

     該試劑盒采用磁珠純化方式,適用于高通量測序文庫(NGS)構建中DNA片段大小快速分選和回收。DNA片段篩選試劑盒的結合緩沖液中含有超順磁珠,根據磁珠懸浮液和樣品的體積比可選擇性結合DNA片段。經過磁性分離和乙醇清洗,低鹽洗脫緩沖液或無核酸酶水洗脫的高純度的DNA片段不含有核苷酸,引物,接頭,酶和鹽等污染物可被直接用于下游應用,比如:酶切、測序、雜交、PCR反應等后續操作。應用于手動或自動液體操作設備。

產品優勢

1. 適合DNA的片段范圍廣:100 bp~50 kb

2. 回收率高:回收率高達80%以上;

3. DNA純度高:回收的PCR產物純度高;

4. 操作快速簡單:20 min即可完成整個操作流程,無需離心;

5. 可適用于自動化、高通量PCR產物純化。

6. 該試劑盒使用步驟和國外beckman Ampure XP高度一致,直接替換

7. 價格低,訂貨期短等明顯優勢。

產品原理

圖1(核酸純化試劑盒大致工作原理)

自備儀器和試劑

1.磁力架 

2.洗滌液:80%乙醇水溶液。

3.洗脫液:Buffer EB10mM Tris-HClpH 8.0);或者RNase-Free Water

操作步驟

請參考Beckman Ampure XP產品,直接替換。

性能實例:

1.核酸片段篩選測試:

測試目的:通過DNA片段篩選測試自主研發試劑盒與國外進口試劑盒性能差異

1)測試平臺:安捷倫2100生物分析儀

2)實驗方法:將大片段DNA打斷后添加磁珠純化試劑盒進行片段篩選,運用兩步法對樣品進行核酸片段篩選回收

2如下:

 

                             

  圖2,安捷倫2100生物分析儀片段選擇對比測試結果:自主研發試劑盒與國際商品化品牌Ampure XP 試劑盒核酸片段回收對比(左圖為Ampure XP品牌核酸純化試劑盒安捷倫2100生物分析儀檢測回收核酸平均片段大小,平均片段大小為265;右圖為自主研發核酸純化試劑盒利用安捷倫2100生物分析儀檢測回收核酸平均片段大小,平均片段大小為265對比結果十分接近

2. DNA回收效率測試

測試目的:檢測對DNA片段的回收效率

實驗方案:大片段DNA打斷后,經試劑盒一步法純化后(1.8X)測試DNA回收效率

3如下:

測試品牌

DNA總投入量

純化后DNA回收效率(%)

Ampure XP-1

5ug

84.20%

Ampure XP-2

5ug

83.87%

HT3001試劑盒-1

5ug

84.40%

HT3001試劑盒-2

5ug

84.12%

 由表3可以看出,DNA回收效率測試結果相近,都達到80%以上。

3.主流測序儀測序測試

測試目的:通過市面上主流基因測序儀平臺檢驗試劑盒穩定性

1)測試平臺:Proton測序平臺

2)實驗步驟:生物樣本提取出核酸后進行文庫制備+上機測序

3)核酸樣品總數12個:6個對照品,6個測試品,其中文庫制備部分,分別采用本公司自主研發的純化試劑盒Ampure XP商品化試劑盒進行核酸純化。

表4如下:

Proton 平臺測試結果

對照組(Ampure XP)

測試組(HT3001)

對比值

唯一比對率

5.17

5.42

0.25

GC含量平均值

41.14

40.85

 - 0.29

原始數據積累平均值

6.88

7.33

0.45

根據表4體現的Proton測序分析結果看,表4中的唯一比對率與原始數據積累平均值越高越好,GC含量平均值對照組與測試組均符合標準。經測試結果分析,自主研發核酸純化試劑盒對比進口商品化試劑盒性能相差無異,能夠有效的替代進口的磁珠純化試劑盒。

4.分選DNA片段推薦試用比例

 

文庫平均長度(插入片段+接頭+引物)

300bp

350bp

400bp

500bp

600bp

700bp

第一次分選磁珠體積

0.8倍

0.7倍

0.6倍

0.55倍

0.5倍

0.45倍

第二次分選磁珠體積

0.2倍

0.2倍

0.2倍

0.15倍

0.15倍

0.15倍


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